MRNA

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mRNA在真核細胞中的交互作用。Pre-mRNA經由轉錄被創造出來;在經過增加5'端帽、剪接和加上多聚腺苷酸尾鏈之後成為mRNA,被運送到細胞質,然後由核糖體進行轉譯產生蛋白質。

mRNA,為 messenger RNA 的簡稱,或稱為信使RNA。mRNA是由DNA經由轉錄而來,帶著相應的遺傳訊息,為下一步轉譯蛋白質提供所需的訊息。在细胞中,mRNA從合成到被降解,經過了數個步驟。在轉錄的過程中,第二型RNA聚合酶(RNA polymerase II)從DNA中複製出一段遺傳訊息到mRNA前體pre-mRNA(尚未經過修飾或是部份經過修飾的mRNA,稱作pre-messenger RNA,pre-mRNA,或是heterogeneous nuclear RNA,hnRNA)上。在原核生物中,除了5'加帽之外mRNA並未被進一步處理(但有些罕有的特例),而經常是邊轉錄邊轉譯。在真核生物中,轉錄跟轉譯發生在細胞的不同位置,轉錄發生在儲存DNA的細胞核中,而轉譯是發生在細胞質中。不過,曾有研究學者認為真核生物亦有邊轉錄邊轉譯的現象[1],只是這個觀點並未被廣泛接受。

在真核生物中,mRNA在準備好轉譯前需要經過多個處理步驟:

  1. 首先pre-mRNA需要加上一個5'端帽(capping)--經過甲基化(methylation)修飾的鳥嘌呤被加到mRNA的5'端。這個5'端帽對於mRNA運輸到細胞質並與之後接到適當的核糖體,以及mRNA本身的穩定是相當重要的。mRNA如果缺乏5'端帽,則很容易就被降解掉。而mRNA由5'到3'的降解亦是由移除5'端帽開始。
  2. mRNA剪接(mRNA splicing)--mRNA前體去除掉內含子而保留外顯子的修飾過程。通常mRNA前體能經由數種不同的剪接方式,產生不同組態/型式的mRNA,使一段基因在不同的組織或發育過程中能經過轉錄-剪接-轉譯後產生不同型式的蛋白質,進而擁有不同的作用,或是產生出穩定性差的mRNA達到調控基因表達的目的。這種剪接型態叫做選擇性剪接。絕大部分mRNA的剪接都是由剪接體所執行,只有少數例外,例如histone mRNA沒有內含子,但是其pre-mRNA卻需要經由另外的剪接方式才能產生成熟mRNA[來源請求]以上所述為分子內剪接(cis-splicing),而mRNA剪接作用亦可發生在不同mRNA分子之間(trans-splicing),後者常見於原生生物的mRNA剪接[來源請求]。除了mRNA之外,有些RNA分子也有能力催化自身的修剪,例如核酸酶會做自我切除,而第I或第II型外顯子在特殊環境下可以不藉由蛋白質酵素的作用而進行剪接,稱為自剪接作用。
  3. 多聚腺苷酸化(polyadenylation)--藉由酵素多聚腺苷酸聚合酶(poly(A)+ polymerase),在mRNA前體的3'端上加上了一段數個腺嘌呤序列(通常是數百個),(這項修飾並不會出現在原核生物中)。這段多聚腺苷酸尾鏈在轉錄的時候,會因為mRNA上一段特殊的訊息,AAUAAA,而在mRNA後方特定位置上加上多聚腺苷酸尾鏈。多聚腺苷酸尾鏈會被多聚腺苷酸結合蛋白(poly(A)+ tail-binding protein, PABP)辨識並保護住。這段AAUAAA訊號的重要性可以從以下這個例子看出:當要轉錄時,DNA分子上的AATAAA片段如果產生突變,將會導致某些血紅素缺陷[2]
  4. 單一核苷酸修飾(RNA editing)--有些mRNA的形成過程中會在特殊的核苷酸上進行修飾,如加上甲基或醇基。而這種修飾會改變tRNA對mRNA上密碼子的識別,更可能改變了蛋白質上胺基酸的組成。

多聚腺苷酸化(polyadenylation)能增加轉錄的半生期,使得mRNA在細胞中的存在時間能延長得久一些,因此能再轉譯出更多的蛋白質。

pre-mRNA在被修飾過之後(形成成熟的mRNA),從而可準備進行轉譯。成熟mRNA從細胞核被送出到細胞質中,置換5'端帽結合蛋白,並形成5'-3'頭尾相連的環狀結構,然後核糖體結合在其上,開始轉譯出蛋白質[來源請求]在經過一段時間之後,mRNA就會被運輸到細胞質的特殊斑塊區(P-bodies)並被一系列的核糖核酸酶(en:RNasesen:Ribonuclease)降解核苷酸[來源請求]

mature eukaryotic mRNA的結構。一個完整的 mRNA 包括有 5'端帽5'非轉譯區編碼區3'非轉譯區和poly(A)尾鏈。

非編碼區/未翻譯區

在RNA啟始密碼子(start codon)之前,與終止密碼子(stop codon)之後,各有一段非編碼區,各被稱作5'UTR與3'UTR,(5'與3'非編碼區,因為DNA與RNA分子都是由5'端到3'端,也就是說這些區域是在RNA分子的兩端)是屬於不轉譯出蛋白質的序列。然而,這些區域的重要性在於它們的序列有可能藉由這些區域與不同的RNA結合蛋白(RNA-binding protein)結合,進而改變在細胞中的位置、決定mRNA的穩定性/半生期,以及對細胞受到刺激時的反應而生的轉譯調控。這些都是與細胞調控本身的活性有關。在UTRs上的某些蛋白質複合物不僅能影響RNA的穩定度,也能促進轉譯效率或是抑制轉譯,這多是依據位在UTRs上的序列而定[來源請求]

一些包含在UTRs的功能性序列,常能形成一些有特性的二級結構,這些造成二級結構也牽扯到調節mRNA本身。某些序列,像是SECIS, 是蛋白質結合區[來源請求]其中一類的mRNA元素,riboswitches,能直接結合上小分子,改變了mRNA自身的摺疊結構,也影響了轉錄或是轉譯作用[來源請求]。另外,有些mRNA的3'UTR含有AU-rich elemnet(ARE),能影響到mRNA的半生期[來源請求]。換句話說,mRNA分子可以進行自我調控。

反義RNA (anti-sense RNA)

在許多真核生物中,當反義RNA上的鹼基與基因的某段mRNA互補時,反義RNA可以抑制轉譯。 反義RNA存在於細胞中之時,其互補的基因就不會合成蛋白質。這也許是一種對抗en:retrotransposons病毒複制的一種機制(retrotransposons是以雙股RNA作中介狀態的转座子),因為這兩者都能使用雙链RNA當中介物。 在生物化學的研究中,藉由使用一段反義mRNA使得標靶mRNA無法作用(RNA干擾),這種方法已經被广泛用于研究基因的功能;例如利用RNA干擾技术,秀麗隱桿線蟲中所有基因的作用幾乎已經被研究完了。

參見

  1. ^ Iborra FJ, Jacson DA, Cook PR(2001年).Coupled transcription and translation within nuclei of mammalian cells.Science,293(5532):1139-42.PMID 11423616 
  2. ^ Higgs DR, Goodbourn SE, Lamb J, Clegg JB, Weatherall DJ, Proudfoot NJ(1983年).Alpha-thalassaemia caused by a polyadenylation signal mutation.Nature,306(5941):398-400.PMID 6646217 
主要生物化学物质种类
| 氨基酸 | 核酸 | 糖类 | 核苷糖 | 脂類 | 萜类 | 类胡萝卜素 | 四吡咯 | 辅因子 | 类固醇 | 类黄酮 | 生物碱 | 聚酮 | 配糖类
Analogues of nucleic acids: 核酸類型 Analogues of nucleic acids:
鹼基 嘌呤腺嘌呤/鳥嘌呤) | 嘧啶尿嘧啶/胸腺嘧啶/胞嘧啶
核苷 腺苷/去氧腺苷 | 鳥苷/去氧鳥苷 | 尿苷 | 胸苷 | 胞苷/去氧胞苷
核苷酸 AMP/UMP/TMP/GMP/CMP | ADP/UDP/TDP/GDP/CDP | ATP/UTP/TTP/GTP/CTP | cAMP/cGMP/cADPR
去氧核苷酸 dAMP/dTMP/dGMP/dCMP | dADP/dTDP/dGDP/dCDP | dATP/dTTP/dGTP/dCTP
核糖核酸 RNA | mRNA | piRNA | tRNA | rRNA | ncRNA | gRNA | shRNA | siRNA | snRNA | miRNA | snoRNA
去氧核糖核酸 DNA | mtDNA | cDNA | 質體 | 黏質體 | BAC | YAC | HAC
核酸相似物 GNA | PNA | TNA | LNA | 嗎啉基(Morpholino)

More about MRNA: mrna codons, mature mrna, dna mrna, mrna trna, function of mrna, mrna transcription, mrna sequence, polycistronic mrna, mrna degradation,

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